Megjegyezzük a fény- és elektronmikroszkópok közötti különbségeket.
Az optikai mikroszkóp és az elektronmikroszkóp közötti különbség az, hogy az optikai mikroszkóp csak bizonyos sejtszerkezeteket képes látni, mint például sejtfalak, kloroplasztiszok, megfestett kromoszómák, mitokondriumok, magok stb. Röviden: a fénymikroszkóp a sejtek mikroszkópos szerkezetét, az elektronmikroszkóp pedig a szubmikroszkópos szerkezetet látja.
A fő különbség a nagyítás. Az optikai mikroszkópoknak van nagyítási határa, és bármilyen nagy a zoom, az emberi szem nem tudja megkülönböztetni. y(min)=0.61*hullámhossz)/(n*sinu) —— Még ha n*sinu-t olajba merítünk is, a maximum körülbelül 1,5, a többi pedig a hullámhossz nagyságától függ. Ezért a maximális optikai mikroszkóp körülbelül 1000-szeres, és felesleges nagyítani. Az elektronmikroszkópok elektronsugarat használnak a képalkotáshoz, és a hullámhossz sokkal kisebb, mint a látható fényé, így a minimális felbontási távolság y(min) sokkal nagyobb. egyre kisebb részleteket lehet feloldani, a nagyítás pedig akár több milliót is elérhet.
