A fény- és elektronmikroszkópok különböznek egymástól. Hasonlítsa össze a hasonló kifejezések változatait.
Az optikai mikroszkóp csak meghatározott sejtszerkezeteket, például sejtfalakat, kloroplasztokat, jelölt kromoszómákat, mitokondriumokat, sejtmagokat stb. képes látni, míg az elektronmikroszkóp minden sejtszerkezetet képes megfigyelni. Leegyszerűsítve: a fénymikroszkóp felfedheti a sejt mikroszkópos szerkezetét, míg az elektronmikroszkóp a szubmikroszkópos összetételét.
A nagyítás az elsődleges megkülönböztetés. Függetlenül attól, hogy mennyi zoomot használunk, az optikai mikroszkópok olyan maximális nagyítással rendelkeznek, amelyet az emberi szem nem tud felismerni. y(min)=0.61*hullámhossz / (n*sinu) A maximum nagyjából 1,5 még akkor is, ha n*sinu olajba merül, a fennmaradó mennyiség pedig a hullámhossz méretétől függ. Ezért hiábavaló a nagyítás, mert egy optikai mikroszkóp maximális nagyítása körülbelül 1000-szeres. Mivel az elektronmikroszkópos képalkotásban használt elektronsugarak hullámhossza lényegesen rövidebb, mint a látható fényé, apró részleteket is képesek feloldani, ami akár több milliós nagyítást tesz lehetővé.
